The X-Files

For å lokalisere en potensiell kur for Scullys sykdom, får Mulder tilgang til et forskningsanlegg, som fører til en forbløffende avsløring om opprinnelsen til hennes kreft.

Scullys løgn om Mulders selvmord gir partneren hennes tid, og han finner flere lik som ligner det i hulen. Han finner også en mulig kur til Scully, som kobler DNA-et sitt til en livsform

I et tilbakeblikk, møtes The Lone Gunmen for første gang og slår seg sammen med Mulder for å stoppe et hemmelig eksperiment av regjeringen som kan ha den amerikanske befolkningen som mål.

Mulder og Scully blir forfulgt av en eldgammel hær av livsfarlige vesener mens de undersøker en gutts påstand om at han ble angrepet av en usynlig skapning.

Mens de etterforsker tilstedeværelsen til et merkelig vesen i en landsby, avdekker agentene et farlig genetisk eksperiment som er helt ute av kontroll.

En mystisk telefonsamtale fører til at Scully etterforsker en kvinnes selvmord og en ung jente som kan være datteren til hennes avdøde søster, Melissa.

Scully prøver å adoptere tre år gamle Emily Sim, bare for å oppdage at jenta har utviklet en urovekkende sykdom som bare kan kureres av bi-produktet til en fryktelig konspirasjon.

Robert Modell (en seriemorder som manipulerer andre) rømmer fra varetekt og etterlater seg med vilje et spor som tilsier at han vil utfordre Mulder.

Mystiske trær blir hovedmistenkte i en rekke uforklarlige dødsfall agentene forsøker å løse.

Rykter om heksekunster og trolldom omgir et bisart drap og leder Scully til en liten jente og en forbannet dukke som kan skjule en morderisk tilstedeværelse.